Natsu et Lucy affrontent les sbires de l’Empereur Zero venus décimer le village. Ce sont, apparemment, des adversaires redoutables. Mais un danger bien pire les attend : Erza est venue les chercher pour les ramener à la guilde ! Grey profi te de sa présence pour donner de plus amples détails sur son passé. Car c’est bien là que se trouvent les raisons des agissements de Léon, son ancien condisciple d’apprentissage...
Le premier étage de l’auberge de Fairy Tail est réservé aux membres les plus puissants. Le tableau des petites annonces regroupe les missions les plus périlleuses : les S-quest. Malgré l’interdiction formulée par Makarof, Natsu et Happy dérobent uneannonce et se lancent dans ce défi en prenant soin d’entraîner Lucy et Grey avec eux. Cette mission va réveiller le douloureux passé de Grey.
Ayant perdu ses parents très tôt, Mavis travaille sur l’île de Tenrô au sein de la guilde Red Lizard pour le maître Jiself, qui la maltraite. Mais, un jour, la guilde est attaquée et détruite par les Blue Skull qui veulent s’emparer du trésor de l’île, le Jade de Tenrô. Lors de l’attaque, Mavis sauve Zera, la fille de Jiself. Ensemble, elles parviennent à s’enfuir.
Le combat contre Zero, le maître des Oracion Seis, fait rage. Les membres de l’Alliance des guildes doivent unifier leurs forces pour le vaincre. Mais la joie de la victoire est de courte durée, les forces du Conseil de la magie faisant arrêter Hot-Eye et Gerald pour qu’ils répondent de leurs actes devant la justice. La menace du Nirvana ayant disparu, chacun retourne chez lui, dans sa guilde. Ou, le cas échéant, en rejoint une nouvelle. Mais l’arrivée de nouveaux éléments, tout comme le retour de certains après une longue absence, n’est pas forcément de bon augure ni sans conséquences.
Le retour de Natsu et de ses compagnons de l'île de Tenrô est maintenant connu dans tout le royaume ! Mais Natsu et les autres découvrent qu'en leur absence, le monde a continué de tourner et que, contrairement à eux, les autres membres de la guilde ont progressé... Ils apprennent aussi que leur chère guilde est connue pour être la plus mauvaise de Fiore ! Pour rendre sa place de meilleure guilde du royaume à Fairy Tail, ils vont devoir trouver une solution pour devenir plus forts rapidement afin de rattraper les sept années perdues dans la Sphère des Fées...
Natsu provoque le maître des Saber Tooth. La tension est à son comble dans l’auberge de la plus forte guilde du royaume. Il faut l’intervention de la propre fille du maître pour ramener notre héros à la raison. Si certains membres des Saber Tooth sont impressionnés, d’autres ne sont pas prêts à oublier l’affront fait à leur guilde... Le tournoi se poursuit malgré tout, les équipes de Fairy Tail remontent petit à petit dans le classement et dans l’estime des spectateurs, mais les sombres desseins des uns et des autres se dévoilent peu à peu...
Lucy termine seconde de l’épreuve aquatique, mais la rancœur de Fairy Tail à l’encontre de Saber Tooth n’en est pas amoindri pour autant. Quand les organisateurs imposent la réunion des équipes A et B, ce sont les membres les plus forts de la guilde qui sont désignés pour continuer le Tournoi. Lors des combats en duo du quatrième jour, Natsu et Gajil se retrouvent face à Sting et Rog, ces derniers sont bien décidés à vaincre leurs anciennes idoles, mais nos deux amis veulent venger Lucy et l’honneur de la guilde... Le combat s’annonce sans merci...
L’équipe de Fairy Tail partie libérer Lucy affronte la troupe des bourreaux les plus redoutables du royaume ! Quand les combats se mettent en place Lucy et Yukino se retrouvent avec Arcadios blessé. N’ayant pas leurs clés, les deux constellationnistes sont dans l’impossibilité de se défendre contre un adversaire capable de faire disparaître ses victimes...Pendant ce temps, pour l’équipe participant au Tournoi, tout se passe selon les prévisions de Mavis, jusqu’à ce qu’Erza se retrouve face à deux adversaires et non des moindres...
Le combat opposant les dragons aux magiciens fait rage ! Le sacrifice d’Ultia ayant permis à ces derniers de faire face et de contre-attaquer ! C’est à cette occasion que Lucy découvre que la destruction de la porte pourrait arranger les choses... Mais deux questions se posent alors, comment détruire une porte construite en un matériau magique des plus résistants et surtout que se passera-t-il concrètement une fois la porte détruite ?
Les géants du Village du soleil sont sauvés et Frea est de retour chez elle ! Natsu et ses amis en profitent pour prendre un repos bien mérité chez Worlod avant de rentrer à Fairy Tail. De son côté Minerva rentre à Succubus Eye mais trouve les lieux ravagés et les autres membres de la guilde transformés en figurine... C’est le fait de Kyôka, un membre de Tartaros, qui cherche à renforcer la guilde clandestine ! Pendant ce temps le Conseil de la magie est la cible d’une attaque au cours de laquelle les neuf conseillers en place sont tués ! Tartaros menace la tranquillité du monde de la magie mais dans quel but ?!
La violence de Tartaros se déchaîne contre les conseillers actuels, ainsi que sur les anciens membres du Conseil. Fairy Tail se charge de leur protection. Les membres de la guilde sont envoyés à travers tout le pays pour affronter les maléfices.
Face a été détruit mais le combat continue de faire rage entre les membres de Fairy Tail et ceux de Tartaros. L'équipe de la Porte des Neuf Démons est de la partie, chacun de nos héros doit faire de son mieux pour se débarrasser de ces redoutables adversaires. Mais quand le combat semble tourner à l'avantage de Fairy Tail, un nouveau membre de Tartaros entre dans la danse et change la donne ! Quand il n'y a plus qu'une Fée en état de se battre, a-t-elle la moindre chance face à des démons ?
Malgré la douleur et la perte de ses cinq sens, Erza ne lâche rien et continue de se battre contre Kyôka ! Le combat aérien opposant Ignir et Acnologia fait rage ! Rejoint par Sting et Rog, Natsu affronte le Roi de Enfers qui n'hésite pas à faire appel à certains de ses serviteurs avant de se montrer sous sa véritable forme ! Mais les membres de Fairy Tail ont, eux aussi, de nouveaux atouts dans leur manche ! Rien n'est perdu, même si le compte à rebours avant le déclenchement de Face continue...
Les derniers membres de Tartaros ne sont plus en état de se battre et Face est détruite. Fairy Tail remporte la victoire et parvient à empêcher la résurrection de E.N.D., l'ultime démon des livres de Zeleph ! Mais alors qu'Ignir va expliquer la raison de sa disparition à Natsu, Acnologia revient à lui et le combat entre les deux dragons reprend de plus belle !
La grande armée de l'empire d'Arbaless conduite par les Douze Guerriers dévoués de Zeleph, les Spriggan Twelve, rue de toutes parts sur Magnoria ! À l'ouest, c'est Ajil qui est le premier à attaquer par les airs avec son vaisseau. Erza intervient pour l'arrêter, mais face à la magie très puissante du 'roi des sables', elle éprouve de grandes difficultés et cela n'annonce rien de bon...
L'ultime affrontement bat son plein et chaque camp se rend coup pour coup. Natsu voit son état de santé se dégrader brutalement ! Il erre dans les limbes de sa conscience à la recherche de sa «mémoire perdue»... Pendant ce temps, sur le front, la tension monte d'un cran. Rahkeid, capable de manipuler les désirs grâce à sa magie blanche, entre en scène et immobilise une grande partie des forces vives de Fairy Tail !
Alors que Natsu avait réussi à mettre à jour les desseins de Zeleph et qu’on croyait la dernière bataille toucher à sa fin, le ciel s’est subitement fissuré ! Et alors qu’on croyait Acnologia prisonnier de l’interstice temporel dans lequel il avait été emprisonné, il a réapparu... Il est parvenu à dissocier son corps et son esprit, et c’est son corps qui commence à tout détruire autour de lui. Lucy et ses compagnons tentent alors le tout pour le tout !
Les membres de Fairy Tail tentent de reformer la guilde ! Parallèlement à cela, Natsu trouve les réponses aux deux grandes énigmes que sont « la vérité sur la dissolution de la guilde » et « les raisons de l'absence de Makarof ». Les révélations s'enchaînent et le voile est levé sur le secret le mieux gardé de Fairy Tail, un secret lié de très près au Gigantesque Royaume militaire d'Arbal…
Les Oracion Seis ont enlevé Wendy ! Cette dernière est la détentrice d’un grand pouvoir de guérison et Brain et les siens veulent l’utiliser pour ressusciter un homme capable de retrouver le Nirvana au milieu de la forêt. Dans le même temps, Erza tombe terrassée par le venin du cobra. Les autres membres de l’équipe se lancent alors à la recherche des Oracion Seis pour leur reprendre Wendy. Mais la forêt est infestée de membres des guildes clandestines aux ordres des Oracion et l’influence néfaste du Nirvana ne simplifie pas les choses. Le combat à venir s’annonce des plus ardus !
Le roi a lancé son impitoyable plan d'éradication. Il a même pris les commandes du Droma Anim (une armure en forme de dragon) pour participer en personne au combat ! Natsu, Gajil et Wendy, les trois chasseurs de dragons combattent cette redoutable arme magique ! Pendant ce temps, Lucy et les autres, associés aux membres de Fairy Tail d'Edolas, affrontent l'armée royale. Quel sera l'aboutissement du choc contre ce roi tenace ?!
Natsu et les membres de sa guilde attendent avec impatience l'épreuve d'accessibilité au rang de mage de classe S.
Grey affronte Ultia, la fille de son maître Oul. Le combat fait d’autant plus rage qu’Ultia voit en Grey le disciple d’une mère qui, à ses yeux, l’a abandonnée. Pendant ce temps, Jubia poursuit Meldy pour lui reprendre Zeleph devenu l’objet de toutes les convoitises des Grimoire Heart. L’affrontement entre Fairy Tail et la redoutable guilde clandestine semble s’approcher de son dénouement... Encore faudra-t-il que Natsu et ses compagnons sortent victorieux du combat contre Hades qui s’annonce !
Gajil conduit un groupe de chasseurs dans le cimetière qu'il a découvert, où ils entendront une partie de l'histoire des dragons et d'Acnologia. Mais Arcadios les rejoint et leur révèle la véritable nature du plan Eclipse.
La dernière épreuve du Grand Tournoi de la magie a enfin été révélée ! Qui recevra le titre de la guilde la plus forte du royaume ? Fairy Tail ou bien Saber Tooth ? Dans les coulisses de la “fête”, c’est le destin du monde qui est en jeu ! La Lucy venue du futur décrit un avenir désespérant où le royaume est attaqué par plus de dix-mille dragons ! Natsu et les autres lui font confiance et décident de trouver un moyen d’y échapper ! Il n’y a plus qu’un seul avenir... Natsu et ses amis pourront-ils le protéger ?Résumé de la série